Auf der sicheren Seite ist man immer wenn man dem Navigation Updater das Kopieren und Formatieren überlässt. Wie schon geschrieben, erkennt ein Mac-OS bestimmte Dateien als systemrelevant und verweigert daher das Kopieren.
Alles nachzulesen in meiner Updateanleitung.
Man kann diese Dateien aber durch eine Tastenkombination sichtbar machen. Aber am besten überlässt man das Kopieren dem Programm.